Yoshimura on Toshiji Yoshimuran toinen poika. Toshiji (1891–1975) oli maailman parhaimpia bonsai-mestareita ja yksi alan parhaista.suiseki(perinteinen japanilaisen taiteen lajityyppi - luonnonkivisommittelu) Japanissa. Hän on myös yksi Japanin Bonsai-seuran perustajista. Tojin isä oli samurai ja kuuluisa puutarhasuunnittelija. Huhtikuussa 1952 31-vuotias Yoshimura aloitti saksalaisen maatalousdiplomaatin Alfred Cohenin tuella bonsaitaiteen kurssien opettamisen ulkomaalaisille Tokiossa. Yoshimura oli eri mieltä vakiintuneen mielipiteen kanssa, jonka mukaan eurooppalaiset eivät pystyisi ymmärtämään, arvostamaan ja teknisesti hallitsemaan bonsaita. Hänen kurssinsa saavuttivat nopeasti suosiota, ja kolmen vuoden kuluessa hän oli kouluttanut yli 600 ihmistä. Heidän joukossaan oli pääasiassa ulkomaalaisia puutarhureita, sotilashenkilöstöä ja liikemiehiä vaimoineen.
Yuji Yoshimura oli ensimmäinen, joka ryhmitteli eribonsai-tyylitviiteen pääluokkaan. Hän myös järjesti aiemmin suullisesti opettajalta oppilaalle välittyneen tiedon. Englanninkielisen oppilaansa Jovan M. Alfordin avustuksella Yoshimura työskenteli tekstien kääntämisen parissa. Kirjan loppuun koottiin empiirisiä tietoja sadoista sommitelmissa käytetyistä kasvilajeista. Vuonna 1957 Charles E. Tuttle Co. julkaisi Rutlandissa, Vermontissa ja Tokiossa teoksen The Japanese Art of Miniature Trees and Landscapes. Vaikka tuolloin oli olemassa useita englanninkielisiä bonsai-kirjoja, tämä oli ensimmäinen, joka tarjosi syvällistä teoriaa ja käytännön esimerkkejä. Jokainen, joka halusi oppiabonsaitaide1900-luvun alkupuoliskolla tätä kirjaa odotettiin innolla. Myöhemmin kirjasta tuli tunnetuksi nimellä "The Bonsai Bible in English", ja siitä otettiin 37 painosta.
Vuonna 1958 Brooklynin kasvitieteellisen puutarhan johtaja George Avery kutsui Yoshimuran Brooklyniin. Yuji saapui Yhdysvaltoihin mukanaan yli tonni opetusmateriaalia ja kuusi viikkoa myöhemmin hän opetti ensimmäisen kurssinsa Brooklynin kasvitieteellisessä puutarhassa nimeltä "Bonsain teoria ja käytäntö". Tämä menestyksekäs kurssi oli yksi monista, joita Yoshimura opetti sinä vuonna. Hän luennoi länsirannikolla ja Havaijilla ennen paluutaan Longwood Gardeniin Philadelphian lähelle.
Vuonna 1962 Yuji Yoshimura vietti kaksi kuukautta Australiassa, missä hän vaikutti merkittävästi bonsaikulttuurin kehitykseen. Se oli vasta syntymässä Australiassa, ja hän auttoi nuoria opettajia ja oppilaita.
Alkuvuodesta 1963 Yoshimura ja jotkut hänen oppilaistaan perustivat Bonsai Societyn New Yorkissa. Kolme vuotta myöhemmin sillä oli 555 jäsentä, joista 339 jäsentä 31 osavaltiossa ja useita ulkomailla.
Vuonna 1972 Yoshimura piti luentoja, joissa hän puhui unelmastaan luoda paikka, jossa amerikkalaiset bonsai-harrastajat voisivat lahjoittaa tai sijoittaa taimiaan tietäen, että heidän puistaan huolehdittaisiin ja että vierailijat nauttisivat niistä monien vuosien ajan. Yhdysvaltain kansallisen arboretumin vasta nimitetty johtaja, tohtori John L. Critch, vieraili säännöllisesti Ishimuran puutarhassa Tokiossa 1950-luvun alussa.
Vaikuttuneena ajatuksesta järjestää ensimmäinen bonsai-näyttely Yhdysvaltain kansallisessa arboretumissa, tohtori Critch alkoi toteuttaa ideaa. Saatuaan tukea hallitukselta hän alkoi hakea apua pitkäaikaisilta tuttaviltaan bonsai-maailmassa. Tuloksena Critch sai lahjaksi 53 bonsaita ja 6 suisekia, joista tuli kokoelman ensimmäiset.Kansallinen bonsaimuseo ja Penjing.
Hän käytti vuosia Yoshimuran filosofian levittämiseen ympäri maailmaa ja tuotti erinomaisia bonsaimestareita.
Vuonna 1982 Yoshimura teki opetuskiertueen Intiassa. Samana vuonna perustettiin National Bonsai Foundation. John Nack, Yuji Ishimura ja John L. Critch valittiin säätiön neuvonantajiksi.
National Bonsai Foundation perusti Yuji Yoshimura -säätiön säilyttääkseen tämän suuren mestarin hengen ja nimen tuleville sukupolville.
Asuttuaan lännessä yli 35 vuotta Yoshimura näki omin silmin bonsaitaiteen kehityksen länsimaisessa kulttuurissa ja sen erot idästä. Vaikka suurin osa hänen oppilaistaan oli Yhdysvalloista, hän opetti klassista bonsaita tuhansille ihmisille ympäri maailmaa. Yuji oli epäilemättä japanilainen bonsaimestari, joka asui useita vuosia kotimaansa ulkopuolella, ja hän on suora linkki klassisen japanilaisen bonsain ja edistyksellisen länsimaisen lähestymistavan välillä. Yoshimura kannusti aina...paikallisten kasvien käyttöja tyyliharrastajille ympäri maailmaa!
