Yoshimura er den andre sønnen til Toshiji Yoshimura. Toshiji (1891–1975) var verdens beste bonsaimester og en av de beste i feltet.suiseki(en tradisjonell sjanger innen japansk kunst – en komposisjon av naturstein) i Japan. Han er også medgründer av Bonsai Society of Japan. Tojis far var samurai og en berømt hagedesigner. I april 1952 begynte 31 år gamle Yoshimura, med støtte fra den tyske landbruksdiplomaten Alfred Cohen, å undervise i bonsai-kunsten for utlendinger i Tokyo. Yoshimura var uenig i den etablerte oppfatningen om at europeere ikke kunne forstå, sette pris på og teknisk mestre bonsai. Kursene hans ble raskt populære, og i løpet av tre år hadde han trent opp mer enn 600 mennesker. Blant dem var hovedsakelig utenlandske gartnere, militært personell og forretningsmenn med konene sine.
Yuji Yoshimura var den første som grupperte de forskjelligebonsai-stileri fem hovedkategorier. Han systematiserte også informasjonen som tidligere hadde blitt gitt muntlig, fra lærer til elev. Med hjelp av sin engelskstudent, Jovan M. Alford, arbeidet Yoshimura med å oversette tekstene. Empirisk informasjon om hundrevis av plantetyper brukt til komposisjoner ble samlet på slutten av boken. I 1957 ble The Japanese Art of Miniature Trees and Landscapes utgitt av Charles E. Tuttle Co. i Rutland, Vermont og Tokyo. Selv om det fantes flere bøker om bonsai på engelsk på den tiden, var dette den første som ga dyptgående teori og praktiske eksempler. Alle som ønsket å lærebonsai-kunstI første halvdel av det tjuende århundre var denne boken etterlengtet. Senere ble boken kjent som «The Bonsai Bible in English» og gikk gjennom 37 utgaver.
I 1958 ble Yoshimura invitert til Brooklyn av George Avery, direktøren for Brooklyn Botanical Garden. Yuji kom til USA med mer enn et tonn undervisningsmateriell, og seks uker senere underviste han i sitt første kurs ved Brooklyn Botanical Garden, kalt «The Theory and Practice of Bonsai». Dette vellykkede kurset var et av mange Yoshimura underviste i det året. Han foreleste på vestkysten og på Hawaii før han returnerte til Longwood Garden nær Philadelphia.
I 1962 tilbrakte Yuji Yoshimura to måneder i Australia, hvor han hadde en betydelig innflytelse på utviklingen av bonsaikulturen. Tross alt var den så vidt i ferd med å spire frem i Australia, og han hjalp unge lærere og elever.
Tidlig i 1963 grunnla Yoshimura og noen av studentene hans Bonsai Society of New York. Tre år senere hadde det 555 medlemmer, inkludert 339 medlemmer i trettien stater og flere i utlandet.
I 1972 holdt Yoshimura foredrag der han snakket om en drøm om å skape et sted for amerikanske bonsai-entusiaster å donere eller plassere plantene sine, vel vitende om at trærne deres ville bli tatt vare på og nytet av besøkende i mange år. Den nyutnevnte direktøren for US National Arboretum, Dr. John L. Critch, var en fast gjest i Ishimuras hage i Tokyo tidlig på 1950-tallet.
Dr. Critch ble imponert over ideen om den første bonsai-utstillingen på US National Arboretum og begynte å implementere den. Etter å ha fått støtte fra myndighetene, begynte han å søke hjelp fra gamle bekjente i bonsai-verdenen. Som et resultat mottok Critch en gave på 53 bonsai og 6 suiseki, som ble de første i samlingen.Nasjonalt bonsaimuseum og Penjing.
Han brukte mange år på å spre Yoshimuras filosofi over hele verden og frembrakte fremragende bonsai-mestere.
I 1982 gjennomførte Yoshimura en undervisningsturné i India. Det året ble også National Bonsai Foundation opprettet. John Nack, Yuji Ishimura og John L. Critch ble valgt som rådgivere for stiftelsen.
Den nasjonale bonsaistiftelsen opprettet Yuji Yoshimura-stiftelsen for å bevare ånden og navnet til denne store mesteren for fremtidige generasjoner.
Etter å ha bodd i Vesten i over 35 år, var Yoshimura vitne til utviklingen av bonsaikunst i vestlig kultur og dens forskjeller fra øst. Selv om de fleste av studentene hans var fra USA, underviste han i klassisk bonsai til tusenvis av mennesker over hele verden. Yuji var utvilsomt en japansk bonsaimester som bodde i mange år utenfor hjemlandet sitt, og han er den direkte forbindelsen mellom klassisk japansk bonsai og den progressive vestlige tilnærmingen. Yoshimura oppmuntret alltidbruk av lokale planterog stilentusiaster over hele verden!
