Jošimura je druhý syn Tošidžiho Jošimury. Tošidži (1891-1975) byl nejlepším světovým mistrem bonsají a jedním z nejlepších v oboru.suiseki(tradiční žánr japonského umění - kompozice z přírodních kamenů) v Japonsku. Je také spoluzakladatelem Japonské společnosti pro bonsaje. Todžiho otec byl samuraj a slavný zahradní designér. V dubnu 1952 začal 31letý Jošimura s podporou německého zemědělského diplomata Alfreda Cohena poprvé v Tokiu učit kurzy umění bonsají pro cizince. Jošimura nesouhlasil s ustáleným názorem, že Evropané nedokážou bonsají pochopit, ocenit a technicky zvládnout. Jeho kurzy si rychle získaly popularitu a během tří let vyškolil více než 600 lidí. Mezi nimi byli především zahraniční zahradníci, vojenský personál a obchodníci s manželkami.
Judži Jošimura byl první, kdo seskupil různéstyly bonsajído pěti hlavních kategorií. Systematizoval také informace, které byly dříve předávány ústně, od učitele ke studentovi. S pomocí svého anglického studenta Jovana M. Alforda pracoval Jošimura na překladu textů. Na konci knihy byly shromážděny empirické informace o stovkách druhů rostlin používaných pro kompozice. V roce 1957 vydalo nakladatelství Charles E. Tuttle Co. z Rutlandu, Vermontu a Tokia knihu Japonské umění miniaturních stromů a krajin. Ačkoli v té době existovalo několik knih o bonsajích v angličtině, tato byla první, která poskytla hloubkovou teorii a praktické příklady. Každý, kdo se chtěl učitbonsajové uměníV první polovině dvacátého století byla tato kniha netrpělivě očekávána. Později se kniha stala známou jako „Bible bonsají v angličtině“ a dočkala se 37 vydání.
V roce 1958 byl Yoshimura pozván do Brooklynu Georgem Averym, ředitelem Brooklynské botanické zahrady. Yuji přijel do Spojených států s více než tunou výukových materiálů a o šest týdnů později vedl svůj první kurz v Brooklynské botanické zahradě s názvem „Teorie a praxe bonsají“. Tento úspěšný kurz byl jedním z mnoha, které Yoshimura v daném roce vedl. Přednášel na západním pobřeží a na Havaji, než se vrátil do Longwood Garden poblíž Filadelfie.
V roce 1962 strávil Judži Jošimura dva měsíce v Austrálii, kde měl významný vliv na rozvoj bonsajové kultury. Koneckonců, v Austrálii se teprve objevovala a on pomáhal mladým učitelům a studentům.
Začátkem roku 1963 založil Jošimura a někteří jeho studenti Bonsajovou společnost v New Yorku. O tři roky později měla 555 členů, z toho 339 členů v jednatřiceti státech a několik v zahraničí.
V roce 1972 Yoshimura přednášel, na nichž hovořil o svém snu o vytvoření místa, kam by američtí nadšenci do bonsají mohli darovat nebo umístit své rostliny s vědomím, že se o jejich stromy bude postaráno a návštěvníci si je budou užívat po mnoho let. Nově jmenovaný ředitel amerického Národního arboreta, Dr. John L. Critch, byl na začátku 50. let pravidelným návštěvníkem Ishimurovy zahrady v Tokiu.
Pod dojmem myšlenky první výstavy bonsají v americkém Národním arboretu začal Dr. Critch tuto myšlenku realizovat. Poté, co získal podporu od vlády, začal hledat pomoc u dlouholetých známých ve světě bonsají. V důsledku toho Critch obdržel darem 53 bonsají a 6 suiseki, které se staly prvními ve sbírce.Národní muzeum bonsají a Penjing.
Strávil mnoho let šířením Jošimurovy filozofie po celém světě a dal vzniknout vynikajícím mistrům bonsají.
V roce 1982 podnikl Jošimura pedagogickou cestu po Indii. V témže roce byla také založena Národní nadace pro bonsaje. John Nack, Judži Išimura a John L. Critch byli zvoleni za poradce nadace.
Národní nadace pro bonsaje založila Nadaci Judžiho Jošimury, aby zachovala ducha a jméno tohoto velkého mistra pro budoucí generace.
Yoshimura, který žil na Západě více než 35 let, byl na vlastní kůži svědkem vývoje bonsajového umění v západní kultuře a jeho odlišností od Východu. Ačkoli většina jeho studentů pocházela ze Spojených států, učil klasické bonsaje tisíce lidí po celém světě. Yuji byl nepochybně japonský mistr bonsajů, který žil mnoho let mimo svou vlast a je přímým spojením mezi klasickými japonskými bonsajemi a progresivním západním přístupem. Yoshimura vždy povzbuzovalvyužití místních rostlina nadšenci do stylu po celém světě!
