Yoshimura és el segon fill de Toshiji Yoshimura. Toshiji (1891-1975) va ser el millor mestre de bonsais del món i un dels millors en el camp.suiseki(un gènere tradicional de l'art japonès: una composició de pedres naturals) al Japó. També és cofundador de la Bonsai Society of Japan. El pare de Toji era un samurai i un famós dissenyador de jardins. L'abril de 1952, Yoshimura, de 31 anys, amb el suport del diplomàtic agrícola alemany Alfred Cohen, va començar a impartir cursos per a estrangers sobre l'art del bonsai a Tòquio. Yoshimura no estava d'acord amb l'opinió establerta que els europeus no podien entendre, apreciar i dominar tècnicament el bonsai. Els seus cursos van guanyar popularitat ràpidament i en tres anys havia format més de 600 persones. Entre ells hi havia principalment jardiners estrangers, personal militar i empresaris amb les seves esposes.
Yuji Yoshimura va ser el primer a agrupar els diversosestils de bonsaien cinc categories principals. També va sistematitzar la informació que anteriorment s'havia transmès oralment, de professor a estudiant. Amb l'ajuda del seu estudiant d'anglès, Jovan M. Alford, Yoshimura va treballar en la traducció dels textos. Al final del llibre es va recopilar informació empírica sobre centenars de tipus de plantes utilitzades per a composicions. El 1957, Charles E. Tuttle Co. de Rutland, Vermont i Tòquio va publicar The Japanese Art of Miniature Trees and Landscapes. Tot i que en aquell moment hi havia diversos llibres sobre bonsai en anglès, aquest va ser el primer a proporcionar teoria en profunditat i exemples pràctics. Qualsevol que volgués aprendreart bonsaiA la primera meitat del segle XX, aquest llibre era molt esperat. Més tard, el llibre va passar a ser conegut com "La Bíblia Bonsai en anglès" i va tenir 37 edicions.
El 1958, George Avery, director del Jardí Botànic de Brooklyn, va convidar Yoshimura a Brooklyn. Yuji va arribar als Estats Units amb més d'una tona de material didàctic i sis setmanes més tard va impartir el seu primer curs al Jardí Botànic de Brooklyn, anomenat "La teoria i la pràctica del bonsai". Aquest curs reeixit va ser un dels molts que Yoshimura va impartir aquell any. Va impartir conferències a la costa oest i a Hawaii abans de tornar al Jardí Longwood, prop de Filadèlfia.
El 1962, Yuji Yoshimura va passar dos mesos a Austràlia, on va tenir un impacte significatiu en el desenvolupament de la cultura del bonsai. Al cap i a la fi, tot just estava sorgint a Austràlia, i va ajudar a joves professors i estudiants.
A principis de 1963, Yoshimura i alguns dels seus estudiants van fundar la Bonsai Society of New York. Tres anys més tard, tenia 555 membres, inclosos 339 membres en trenta-un estats i diversos a l'estranger.
El 1972, Yoshimura va impartir conferències en què va parlar del somni de crear un lloc perquè els entusiastes americans del bonsai donessin o col·loquessin les seves plantes, sabent que els seus arbres serien cuidats i gaudits pels visitants durant molts anys. El recentment nomenat director de l'Arboretum Nacional dels Estats Units, el Dr. John L. Critch, era un visitant habitual del jardí d'Ishimura a Tòquio a principis dels anys cinquanta.
Impressionat per la idea de la primera exposició de bonsais a l'Arboretum Nacional dels Estats Units, el Dr. Critch va començar a implementar la idea. Després d'haver rebut el suport del govern, va començar a buscar ajuda de coneguts de llarga data del món del bonsai. Com a resultat, Critch va rebre un regal de 53 bonsais i 6 suiseki, que es van convertir en els primers de la col·lecció.Museu Nacional del Bonsai i Penjing.
Va passar molts anys difonent la filosofia de Yoshimura arreu del món i va produir mestres bonsai destacats.
El 1982, Yoshimura va dur a terme una gira docent per l'Índia. També aquell any, es va establir la Fundació Nacional del Bonsai. John Nack, Yuji Ishimura i John L. Critch van ser elegits com a assessors de la fundació.
La Fundació Nacional del Bonsai va crear la Fundació Yuji Yoshimura per preservar l'esperit i el nom d'aquest gran mestre per a les generacions futures.
Havent viscut a Occident durant més de 35 anys, Yoshimura va ser testimoni de primera mà del desenvolupament de l'art del bonsai a la cultura occidental i les seves diferències respecte a l'Orient. Tot i que la majoria dels seus estudiants eren dels Estats Units, va ensenyar bonsai clàssic a milers de persones arreu del món. Sens dubte, Yuji va ser un mestre de bonsai japonès que va viure durant molts anys fora de la seva terra natal i és l'enllaç directe entre el bonsai clàssic japonès i l'enfocament occidental progressista. Yoshimura sempre va animarús de plantes localsi entusiastes de l'estil de tot el món!
