Jošimura je druhý syn Tošidžiho Jošimuru. Tošidži (1891 – 1975) bol najlepším majstrom bonsajov na svete a jedným z najlepších v tomto odbore.suiseki(tradičný žáner japonského umenia - kompozícia z prírodných kameňov) v Japonsku. Je tiež spoluzakladateľom Japonskej spoločnosti pre bonsaje. Todžiho otec bol samuraj a slávny záhradný dizajnér. V apríli 1952 31-ročný Jošimura s podporou nemeckého poľnohospodárskeho diplomata Alfreda Cohena prvýkrát začal v Tokiu učiť kurzy umenia bonsaje pre cudzincov. Jošimura nesúhlasil so zaužívaným názorom, že Európania nedokážu bonsaje pochopiť, oceniť a technicky zvládnuť. Jeho kurzy si rýchlo získali popularitu a do troch rokov vyškolil viac ako 600 ľudí. Medzi nimi boli najmä zahraniční záhradníci, vojenský personál a podnikatelia s manželkami.
Judži Jošimura bol prvý, kto zoskupil rôzneštýly bonsajovdo piatich hlavných kategórií. Systematizoval tiež informácie, ktoré sa predtým odovzdávali ústne, z učiteľa na študenta. S pomocou svojho anglického študenta Jovana M. Alforda Jošimura pracoval na preklade textov. Na konci knihy boli zhromaždené empirické informácie o stovkách druhov rastlín používaných na kompozície. V roku 1957 vydalo vydavateľstvo Charles E. Tuttle Co. z Rutlandu, Vermontu a Tokia knihu Japonské umenie miniatúrnych stromov a krajiny. Hoci v tom čase existovalo v angličtine niekoľko kníh o bonsajoch, táto bola prvá, ktorá poskytla podrobnú teóriu a praktické príklady. Každý, kto sa chcel učiťbonsajové umenieV prvej polovici dvadsiateho storočia bola táto kniha netrpezlivo očakávaná. Neskôr sa kniha stala známou ako „Bonsajová biblia v angličtine“ a prešla 37 vydaniami.
V roku 1958 pozval Jošimuru do Brooklynu George Avery, riaditeľ Brooklynskej botanickej záhrady. Judži prišiel do Spojených štátov s viac ako tonou učebných materiálov a o šesť týždňov neskôr viedol svoj prvý kurz v Brooklynskej botanickej záhrade s názvom „Teória a prax bonsajov“. Tento úspešný kurz bol jedným z mnohých, ktoré Jošimura v tom roku viedol. Prednášal na západnom pobreží a na Havaji, potom sa vrátil do Longwood Garden neďaleko Philadelphie.
V roku 1962 strávil Judži Jošimura dva mesiace v Austrálii, kde mal významný vplyv na rozvoj bonsajovej kultúry. Koniec koncov, v Austrálii sa práve objavovala a on pomáhal mladým učiteľom a študentom.
Začiatkom roku 1963 založil Jošimura a niektorí jeho študenti Bonsajovú spoločnosť v New Yorku. O tri roky neskôr mala 555 členov, vrátane 339 členov v tridsiatich jednej štátoch a niekoľkých v zahraničí.
V roku 1972 prednášal Jošimura, v ktorých hovoril o sne o vytvorení miesta, kde by americkí nadšenci bonsajov mohli darovať alebo umiestňovať svoje rastliny s vedomím, že o ich stromy sa bude starať a návštevníci si ich budú užívať dlhé roky. Novovymenovaný riaditeľ Národného arboréta USA, Dr. John L. Critch, bol začiatkom 50. rokov 20. storočia pravidelným návštevníkom Išimurovej záhrady v Tokiu.
Ohromený myšlienkou prvej bonsajovej výstavy v Národnom arboréte USA, Dr. Critch začal túto myšlienku realizovať. Po získaní podpory od vlády začal hľadať pomoc od dlhoročných známych vo svete bonsajov. Výsledkom bolo, že Critch dostal dar 53 bonsajov a 6 suiseki, ktoré sa stali prvými v zbierke.Národné múzeum bonsajov a Penjing.
Strávil mnoho rokov šírením Jošimurovej filozofie po celom svete a dal vzniknúť vynikajúcim majstrom bonsajov.
V roku 1982 Jošimura uskutočnil pedagogickú cestu po Indii. V tom istom roku bola založená aj Národná bonsajová nadácia. Za poradcov nadácie boli zvolení John Nack, Judži Išimura a John L. Critch.
Národná nadácia pre bonsaje založila Nadáciu Judžiho Jošimuru, aby zachovala ducha a meno tohto veľkého majstra pre budúce generácie.
Po viac ako 35 rokoch života na Západe bol Jošimura na vlastné oči svedkom vývoja bonsajového umenia v západnej kultúre a jeho odlišností od Východu. Hoci väčšina jeho študentov pochádzala zo Spojených štátov, učil klasické bonsaje tisíce ľudí po celom svete. Judži bol nepochybne japonský majster bonsajov, ktorý žil mnoho rokov mimo svojej vlasti a je priamym spojením medzi klasickými japonskými bonsajami a progresívnym západným prístupom. Jošimura vždy povzbudzoval...využitie miestnych rastlína nadšencov štýlu po celom svete!
