Yoshimura jest drugim synem Toshiji Yoshimury. Toshiji (1891-1975) był najlepszym mistrzem bonsai na świecie i jednym z najlepszych w tej dziedzinie.suiseki(tradycyjny gatunek japońskiej sztuki - kompozycja naturalnych kamieni) w Japonii. Jest również współzałożycielem Bonsai Society of Japan. Ojciec Toji był samurajem i znanym projektantem ogrodów. W kwietniu 1952 roku 31-letni Yoshimura, przy wsparciu niemieckiego dyplomaty rolniczego Alfreda Cohena, rozpoczął pierwsze kursy dla cudzoziemców na temat sztuki bonsai w Tokio. Yoshimura nie zgadzał się z ugruntowaną opinią, że Europejczycy nie potrafią zrozumieć, docenić i technicznie opanować bonsai. Jego kursy szybko zyskały popularność i w ciągu trzech lat przeszkolił ponad 600 osób. Byli wśród nich głównie zagraniczni ogrodnicy, personel wojskowy i biznesmeni z żonami.
Yuji Yoshimura był pierwszym, który zgrupował różnestyle bonsaina pięć głównych kategorii. Usystematyzował również informacje, które wcześniej były przekazywane ustnie, od nauczyciela do ucznia. Z pomocą swojego ucznia języka angielskiego, Jovana M. Alforda, Yoshimura pracował nad tłumaczeniem tekstów. Informacje empiryczne na temat setek rodzajów roślin używanych do kompozycji zostały zebrane na końcu książki. W 1957 roku, The Japanese Art of Miniature Trees and Landscapes została opublikowana przez Charles E. Tuttle Co. z Rutland, Vermont i Tokio. Chociaż w tamtym czasie istniało kilka książek o bonsai w języku angielskim, była to pierwsza, która zawierała dogłębną teorię i praktyczne przykłady. Każdy, kto chciał się uczyćsztuka bonsaiW pierwszej połowie XX wieku ta książka była wyczekiwana z niecierpliwością. Później stała się znana jako „The Bonsai Bible in English” i doczekała się 37 wydań.
W 1958 roku Yoshimura został zaproszony do Brooklynu przez George'a Avery'ego, dyrektora Brooklyn Botanical Garden. Yuji przyjechał do Stanów Zjednoczonych z ponad toną materiałów dydaktycznych i sześć tygodni później poprowadził swój pierwszy kurs w Brooklyn Botanical Garden, zatytułowany „Teoria i praktyka bonsai”. Ten udany kurs był jednym z wielu, które Yoshimura poprowadził w tym roku. Wykładał na zachodnim wybrzeżu i na Hawajach, zanim wrócił do Longwood Garden w pobliżu Filadelfii.
W 1962 roku Yuji Yoshimura spędził dwa miesiące w Australii, gdzie miał znaczący wpływ na rozwój kultury bonsai. W końcu dopiero się rozwijała w Australii, a on pomagał młodym nauczycielom i uczniom.
Na początku 1963 roku Yoshimura i kilku jego studentów założyło Bonsai Society of New York. Trzy lata później liczyło ono 555 członków, w tym 339 członków z trzydziestu jeden stanów i kilku z zagranicy.
W 1972 roku Yoshimura wygłosił wykład, w którym mówił o marzeniu stworzenia miejsca, w którym amerykańscy entuzjaści bonsai mogliby przekazywać lub umieszczać swoje rośliny, wiedząc, że ich drzewa będą pielęgnowane i będą cieszyły oczy odwiedzających przez wiele lat. Nowo mianowany dyrektor US National Arboretum, dr John L. Critch, był regularnym gościem w ogrodzie Ishimury w Tokio na początku lat 50.
Pod wrażeniem pomysłu pierwszej wystawy bonsai w US National Arboretum, dr Critch zaczął realizować ten pomysł. Otrzymawszy wsparcie od rządu, zaczął szukać pomocy u długoletnich znajomych ze świata bonsai. W rezultacie Critch otrzymał w prezencie 53 bonsai i 6 suiseki, które stały się pierwszymi w kolekcji.Narodowe Muzeum Bonsai i Penjing.
Przez wiele lat propagował filozofię Yoshimury na całym świecie i wychował wybitnych mistrzów bonsai.
W 1982 r. Yoshimura odbył tournée edukacyjne po Indiach. Również w tym roku powstała National Bonsai Foundation. John Nack, Yuji Ishimura i John L. Critch zostali wybrani na doradców fundacji.
Narodowa Fundacja Bonsai powołała do życia Fundację Yuji Yoshimura, której celem jest zachowanie ducha i imienia tego wielkiego mistrza dla przyszłych pokoleń.
Mieszkając na Zachodzie przez ponad 35 lat, Yoshimura był naocznym świadkiem rozwoju sztuki bonsai w kulturze zachodniej i jej różnic w stosunku do Wschodu. Chociaż większość jego uczniów pochodziła ze Stanów Zjednoczonych, uczył klasycznego bonsai tysiące ludzi na całym świecie. Niewątpliwie Yuji był japońskim mistrzem bonsai, który przez wiele lat mieszkał poza swoją ojczyzną i jest bezpośrednim łącznikiem między klasycznym japońskim bonsai a postępowym podejściem zachodnim. Yoshimura zawsze zachęcałwykorzystanie lokalnych roślini miłośników stylu na całym świecie!
